بیوانفورماتیک

ساخت پروتئین با اسیدهای آمینه غیرطبیعی

استفاده از اسیدهای آمینه غیرطبیعی در طراحی پروتئین

پروتئین‌ها ماشین‌های مولکولی هستند که بر اساس دستورالعمل‌های موجود در ژنوم با استفاده از اسیدهای آمینه ساخته می‌شوند. سپس این رشته‌ها تا خورده و ساختارهای پیچیده سه‌بعدی ضروری برای انجام کار ویژه خود را شکل می‌دهند. گروهی از پژوهشگران برای ساخت تعدادی از پروتئین‌های فلورسنت جدید، از اسیدآمینه فلورسنتی استفاده می‌کنند که در طبیعت یافت نمی‌شود. از این پروتئین‌ها تصاویری در سطح اتمی تولید شده است. داده‌ها حاصل می‌تواند در طراحی منطقی حسگرهای فلورسنت مبتنی بر پروتئین استفاده شود.

استفاده از اسیدهای آمینه غیرطبیعی در طراحی پروتئین بیشتر بخوانید »

تکامل آنزیم با استفاده از تکامل هدایت‌شده

شناخت تکامل آنزیم راه را برای شیمی سبز هموار می‌کند

پژوهشگران نشان داده‌اند که چگونه تکامل آزمایشگاهی می‌تواند منجر به تولید آنزیم‌های بسیار مؤثر برای انجام واکنش‌هایی شود که برای طبیعت جدید هستند و راه را برای روش‌های نوین و سازگار با محیط‌زیست برای ساخت داروها و سایر مواد شیمیایی باز کند.

شناخت تکامل آنزیم راه را برای شیمی سبز هموار می‌کند بیشتر بخوانید »

گل آرابیدوپسیس تالیانا

نگاهی نو به تکامل تولیدمثل گیاهان خشکی

تکامل در تنوع اندام‌ها، مانند ریشه، برگ یا گامت‌های بی‌حرکت، نیازمند تغییرات ژنتیکی هماهنگی است. در مطالعه‌ای جدید دانشمندان اطلسی را معرفی کردند که داده‌های بیان ژن ده گونه مختلف گیاهان خشکی را گردآوری کرده است. محققان با کمک این اطلس با تمرکز بر تجزیه‌وتحلیل دقیق داده‌های جمع‌آوری‌شده، به دنبال شناسایی اجزای جدید و ازقلم‌افتاده در تشکیل اندام‌ها و سلول‌های جنسی بوده‌اند.

نگاهی نو به تکامل تولیدمثل گیاهان خشکی بیشتر بخوانید »

RoseTTAFold نرم‌افزار پیشگویی ساختار پروتئین

دسترسی همگانی به پیشگویی دقیق ساختار پروتئین با استفاده از RoseTTAFold

پژوهشگران طراح پروتئین روشی به نام RoseTTAFold ایجاد کرده‌اند که دسترسی به پیشگویی بسیار دقیق ساختار پروتئین را به‌رایگان امکان‌پذیر می‌کند. دانشمندان از سراسر جهان از آن استفاده می‌کنند تا مدل‌های پروتئینی بسازند و به تحقیقات خود سرعت ببخشند. این ابزار از یادگیری عمیق استفاده می‌کند تا به‌سرعت ساختارهای پروتئینی را بر اساس اطلاعات محدودی پیشگویی کند. در نتیجه برای انجام کاری که تنها برای یک پروتئین سال‌ها کار آزمایشگاهی نیاز داشته است، زمان بسیار کمتری صرف می‌شود. پیشگویی شکل‌های پیچیده پروتئین‌های ضروری برای فرآیندهای زیستی خاص می‌تواند توسعه درمان را برای بسیاری از بیماری‌ها را تسریع کند.

دسترسی همگانی به پیشگویی دقیق ساختار پروتئین با استفاده از RoseTTAFold بیشتر بخوانید »

یک اطلس ژنتیکی نوین برای بیماری‌های خود ایمنی

محققان در ژاپن نخستین پایگاه داده ژنتیکی مربوط به بیماری‌های خودایمن و خود‌التهابی را تهیه کرده‌اند. این اطلس نخستین پایگاه داده از این نوع است. این پایگاه داده به متخصصان امکان می‌دهد تا درک عمیق‌تری از چگونگی بروز اختلالات ایمنی بدن به دست آورند و پروژه‌های آینده کشف دارو را برنامه‌ریزی کنند.

یک اطلس ژنتیکی نوین برای بیماری‌های خود ایمنی بیشتر بخوانید »